为了探明日本列岛一系列的异常地壳运动情况,地球物理学者田所雄介博士(小林桂树 饰)与助手幸长信彦(泷田裕介 饰)乘坐小野寺俊夫(藤冈弘 饰)驾驶的潜艇出海考察。在小笠原群岛附近的海沟处,海底莫名其妙的乱泥流令博士忧心忡忡。经过对各方材料缜密慎重的调查,田所博士作出一个震惊全国乃至世界的预测“由于地球变动,日本即将在两年之内完全沉入海底”。他的预测起初并未得到政府的完全信任,然而在此之后各地强烈地震相继爆发,休灭火山也重新喷发,事态正以出乎意料的速度恶化。在这个与世隔绝的岛国,人民陷入前所未有的疯狂之中......